玉门关遗址的遗存主要包括小方盘城遗址、大方盘城遗址、汉长城边墙及烽遗址(包括 20 座烽、18 段长城边墙遗址)，东起仓亭憋，西至显明，东西长约45公里、南北宽约05公里的区域内以小方盘城遗址为中心呈线性分布。现在对外开放的有小方盘城、大方盘城和汉长城遗址。
玉门关，俗称小方盘城，始建于汉武帝开通西域道路、设置河西四郡之时。现存关城呈方形，四周城垣保存完好，为黄胶土夯筑，开西、北两门。城墙高达10米，上宽3米，下宽5米，上有城墙，下有马道。曾是汉晋时期中原通向西域诸国的咽喉之地。
汉长城是汉代河西地区军事防御体系中重要的组成部分，也是西汉王朝构建整个北方防御工程的历史缩影。当谷嫁段的汉长城遗址为我国目前保留最完整的一段汉长城。
河仓城，俗称“大方盘城”。建于西汉，直至魏晋时一直是长城边防储备粮食的重要军需仓库。河仓城由南向北，夯土版筑，呈长方形。东西长约132米，南北宽约17米，残垣最高处9米，城内有南北方向的两堵墙，将其隔为相等并排的三座仓库。每库向南开一门。四壁多已颓塌，只有北壁较为完整。东西北三面被草地和沼泽包围，南面为高出沼泽的戈壁所掩护，位置险要，隐蔽安全，选址极其考究。
